Search results for "Molekulārā bioloģija"
showing 10 items of 16 documents
The immunoprotective and diagnostic potential of influenza virus haemagglutinin stalk domain for development of novel vaccine prototypes
2022
Pret konservatīviem gripas vīrusa epitopiem mērķēta vakcīna varētu paplašināt inducēto imunitāti un novērst nepieciešamību pēc ikgadējas vakcīnas komponentu atjaunošanas. Lai noteiktu stalka specifisko imunitāti cūkkopības darbinieku pirms pandēmijas serumā, tika izmantots gripas vīrusa stalks. Uz VLP eksponēts lineārs stalks izsauca plašu antivielu atbildi pelēs, taču neaizsargāja pret slimības simptomiem. Rentgenstaru kristalogrāfija un cietvielu KMR uzrādīja trimēra zema pH formas saglabāšanos pēc ķīmiskas VLP funkcionalizācijas. Uz VLP eksponēts stalks inducēja plašu antivielu atbildi, bet nepasargāja no letālām gripas vīrusu infekcijām. Uz vienas daļiņas vienlaicīgi eksponēts stalks un…
Biomolecular characterization of the ancient microbiome in archaeological samples in Latvia
2022
Senā cilvēka mikrobioma izpētes joma pēdējo gadu laikā ir strauji attīstījusies. Mūsdienu sekvencēšanas tehnoloģijas ļauj mums piekļūt vērtīgai informācijai par vēsturiskām mikroorganismu kopām. Līdz šim nav veikti pētījumi par vēsturisko mikrobiomu Latvijas arheoloģiskajos paraugos. Savā darbā esmu pētījusi senās DNS (aDNS) datu kopas un mikrobioma sastāvu arheoloģiskos pēcviduslaiku cilvēka kaulu, zobu un zobakmens paraugos Latvijā, Ziemeļeiropā, kas ir datēti ar mūsu ēras 15.–17.gadsimtu. Kopumā šajā darbā tika pētīts vēsturiskais cilvēka mikrobioms, novērtēta seno biomolekulu saglabāšanas pakāpe dažādos pēcviduslaiku arheoloģiskajos paraugos un raksturota iespējamā apbedījumu vides mikr…
Interrelation of mitochondrial DNA and telomere length alterations in ageing human population
2018
Līdz šim nav veikti pētījumi Latvijas populācijā, kas aprakstītu telomēru garuma (TG) un mitohondriālā DNS (mtDNS) izmaiņas, un to saistību novecošanas procesā. Tas ir zināms, ka telomēri un mitohondriji ir savā starpā saistīti un virza izmaiņas šūnu līmenī novecojot. Šie signāl-ceļi var būt atkarīgi no nelielām izmaiņām kodola DNS vai mtDNS, novedot pie paātrinātas novecošanās vai slimībām. Savā darbā esmu apstiprinājusi, ka šie divi šūnu komponenti ir svarīgi un ir saistīti ar novecošanos. Kā arī parādīju, ka TG un mtDNS izmaiņas ir savādākas cilvēkiem, kuri nodzīvo pāri 90 gadiem. Kā arī, ka labdabīgas vai nelielas mtDNS sekvenču izmaiņas neietekmē TG, mtDNS daudzumu asins šūnās vai ilgd…
Development of approach for exploration of autoantibody profiles in cancer patients and identification of autoantibody signature for diagnosis of gas…
2012
ANOTĀCIJA. Autoantivielu profilu analīzes metodikas izstrāde un kuņģa vēža diagnostikā nozīmīgu autoantivielu identificēšana Šī darba mērķis bija izstrādāt fāgu displeja antigēnu mikročipu izgatavošanas un apstrādes tehnoloģiju un mikročipa datu analīzes procedūras, un izmantot tās autoantivielu profilu izpētei pacientiem ar kuņģa vēzi, kuņģa iekaisuma slimībām un veseliem indivīdiem, kā arī humorālo imūno atbilžu noteikšanai pret spermas-asociētajiem antigēniem. Tika izstrādātas procedūras divupakāpju mikročipa datu normalizēšanai, kas definē atskaites punktus un ranžē antigēnus, ļaujot atšķirt serum-pozitīvu no serum-negatīva signāla, un veikt kvantitatīvas analīzes. Tika identificēts 45-…
MOLECULAR SIGNATURES FOR THERAPEUTIC EFFECTIVENESS AND RISK OF COMPLICATIONS IN TYPE 2 DIABETES MELLITUS
2022
Lai uzlabotu T2D kontroli, ir nepieciešams izstrādāt biomarķierus T2D komplikāciju riska un terapijas efektivitātes prognozēšanai. Metformīna molekulāro efektu novērtēšanai veselos indivīdos un T2D pacientos tika izmantota longitudināla, uz RNS sekvencēšanu balstīta in vivo transkriptomikas pieeja perifērās asins šūnās. Ar genoma mēroga genotipēšanu tika identificēti T2D komplikāciju risku noteicoši ģenētiskie faktori. Pētījums atklāja potenciālus, uz gēnu ekspresiju balstītus biomarķierus metformīna efektivitātes prognozēšanai, norādot uz indivīd-specifiskām izmaiņām transkriptoma profilos. Latvijas populācijā tika atklāti desmit jauni, ar T2D komplikāciju attīstību saistīti lokusi, tostar…
Molecular Mechanisms Underlying Rare Neuromuscular Diseases
2021
Termins neiromuskulārās slimības attiecas uz plašu slimību profilu, ko izraisa motorās vienības deficīti. Darba fokuss ir neiromuskulāro slimību apakšgrupa – muskuļu distrofijas, un tas tika uzsākts ar mērķi palīdzēt neiromuskulāro slimību diagnostikai Latvijā un attīstīt to. Dati, kas savākti vairāk kā desmit gadus garā periodā, dod pirmo ieskatu šo slimību biežumos Latvijā un pierāda teoriju par augstu neviendabīgumu gan neiromuskulārajās slimībās, gan Latvijas populācijā vispārīgi. Izmantojot visus pieejamos zinātniskos rīkus, tiek aprakstīti un klasificēti ar slimībām saistītie ģenētiskie varianti. Darba gaitā atklāta jauna slimība - miotremors, kas saistīta ar domēn-specifiskām mutācij…
Melanoma predisposition genes in the Latvian population
2019
Ādas melanoma ir ļaundabīgākais ādas audzējs. Darba mērķis bija izvērtēt augsta, vidēja un zema melanomas riska gēnu ietekmi uz melanomas attīstību un izdzīvotību Latvijas populācijā. Pirmo reizi Latvijā atrasts CDKN2A variants, kas saistīts ar melanomas attīstību. Atrasta trešā ģimene Latvijā ar atkārtotiem melanomas saslimšanas gadījumiem un variantu p.Arg24His CDK4 gēnā. Galvenais riska variants sporādiskajiem melanomas pacientiem Latvijā ir vidēja riska gēna MC1R variants p.Arg151Cys. Melanomas risks ir atkarīgs no MC1R variantu skaita, un to veidotais risks ir neatkarīgs no pigmentācijas fenotipa. Vidēja un zema melanomas riska gēnu MITF, TP53 un MDM2 variantiem ir maza ietekme uz mela…
Structural analysis of the infectious phenotype associated outer surface lipoproteins from Borrelia burgdorferi paralogous gene family PFam54
2014
Laima slimība ir ērču pārnēsāta infekcijas slimība, kuras izraisītājs ir spiroheta Borrelia burgdorferi. Inficētu Ixodes ērču barošanās laikā baktērija var nonākt zīdītāja organismā. Ērcei uzsākot asins sūkšanas procesu, B. burgdorferi spēj izmainīt vairāku gēnu ekspresijas līmeni kā atbildes reakciju uz temperatūras, šūnu blīvuma, pH un barības vielu pieejamības izmaiņām. Daudzi no B. burgdorferi gēniem, kuru ekspresijā tiek novērotas izteiktas izmaiņas, kodē dažādus ārējās virsmas proteīnus, savukārt šie ārējās virmas proteīni tiek saistīti ar Laima slimības patoģenēzi. Tieši ārējās virsmas proteīni var potenciāli nodrošināt baktērijas pārnesi no ērces uz zīdītāja organismu, kā arī pielāg…
Agro jauno laiku Rīgas kapsētu apbedījumu izpēte ar senās DNS analīzēm: nozīmīgākās pieejas un izpētes perspektīvas
2020
Bakalaura darba mērķis ir noskaidrot, kā ar senās DNS analīžu palīdzību ir iespējams papildināt jau esošās zināšanas, kas iegūtas ar tādām pētniecības metodēm kā literatūras un avotu analīze, kā arī arheoloģijas metodēm, kā piemēru izmantojot konkrētus agro jauno laiku Rīgas apbedījumus. Darba ietvaros tika veikta senās DNS izdalīšana un analīze, kuras rezultāti sasaistīti ar apbedījumu arheoloģisko un vēsturisko kontekstu, tādejādi izvirzot populāciju ģenētikas teorijā balstītas hipotēzes par konkrēto indivīdu izcelsmi. Darba rezultātā noteikta aptuvena izcelsme no mātes puses trijiem un dzimums visiem sešiem no pētāmajiem indivīdiem. Apbedītajiem konstatēti dažādi izcelsmes reģioni, kas a…
Novel genetic risk factors associated with three multifactorial traits and their clinical characteristics in Latvian population
2018
Koronārā sirds slimība (KSS), diabēts un hipofīzes adenoma (HA) ir multifaktoriālas slimības ar pieaugošu mirstību visā pasaulē. Promocijas darba mērķis ir izpētīt ADORA3 polimorfismu ietekmi uz KSS un GLO1 variantu ietekmi uz diabēta komplikācijām, kā arī HA ģenētiskos cēloņus Latvijas populācijā. Pētījumu laikā atklājās rs35511654 ADORA3 asociācija ar aizsardzību pret KSS, polimorfismam modulējot išēmijas izraisītos bojājumus. Divi GLO1 polimorfismi ir asociēti ar samazinātu Glo1 enzīma aktivitāti, bet rets MEN1 polimorfisms rs2959656 bija būtiski asociēts ar klīniski nozīmīgu HA. Pētījumu rezultāti ir prezentēti četrās zinātniskās publikācijās starptautiski citējamos žurnālos un papildin…